東一織 / Iori Azuma
- 東京大学大学院 薬学系研究科 分子薬物動態学教室 博士課程
- 生命科学技術国際卓越大学院プログラム WINGS-LST
- 日本学術振興会 特別研究員 (DC2)
Education
- 2023/3 東京大学大学院 薬学系研究科 修士課程 修了
- 2021/3 東京大学 薬学部 卒業
- 2017/3 広島大学附属福山高等学校 卒業
Research Interests
- 肝機能障害における免疫応答の理解
- deconvolution法による免疫細胞比率の推定
- 肝臓のHE染色切片および血液塗抹標本を用いた画像解析
- 細胞間相互作用ネットワーク解析
- 臨床データ解析
- 薬効予測モデル(副作用、適応症、薬物間相互作用など)
- 有害事象報告システムを用いた疫学研究
Publications and Preprints
- Iori Azuma, Tadahaya Mizuno, Hiroyuki Kusuhara, “Extraction of diverse gene groups with individual relationship from gene co-expression networks”, arXiv, 2021
- Iori Azuma, Tadahaya Mizuno, Hiroyuki Kusuhara, “NRBdMF: A Recommendation Algorithm for Predicting Drug Effects Considering Directionality”, J Chem Inf Model., 2023
- Katsuhisa Morita, Tadahaya Mizuno, Iori Azuma, Yutaka Suzuki, Hiroyuki Kusuhara, “Rat Deconvolution as Knowledge Miner for Immune Cell Trafficking from Toxicogenomics Databases”, Toxicol Sci., 2023
- Iori Azuma, Tadahaya Mizuno, Katsuhisa Morita, Yutaka Suzuki, Hiroyuki Kusuhara, “Investigation of the usefulness of liver-specific deconvolution method by establishing a liver benchmark dataset”, NAR Genom Bioinform., 2024
- Iori Azuma, Tadahaya Mizuno, Hiroyuki Kusuhara, “GLDADec: marker-gene guided LDA modelling for bulk gene expression deconvolution”, Brief Bioinform., 2024 Press Release
- Takumi Iwasaka, Tadahaya Mizuno, Katsuhisa Morita, Iori Azuma, Tomoka Nakagawa, Eri Nakashima, Hiroyuki Kusuhara, “Establishment of an easy-to-construct liver injury mouse model for longitudinal analysis by drinking-water administration of 4,4’-methylenedianiline”, bioRxiv, 2024
Conferences
International (Poster)
- Iori Azuma, Tadahaya Mizuno, Hiroyuki Kusuhara, “Investigation of matrix factorization methods employed in drug repositioning”, GPEN2022, A22, University of Minnesota, 10/2022
- Iori Azuma, Tadahaya Mizuno, Hiroyuki Kusuhara, “Marker gene-based deconvolution to reveal the immune response from drug-induced transcriptome”, GPEN2024, P30, University of Copenhagen, 7/2024
Domestic (Oral)
- 東 一織, 水野 忠快, 楠原 洋之, “ドラッグリポジショニングに向けた行列分解機械学習推薦システムの層別化と性能評価”, 第37回日本薬剤学会, 2C-06, オンライン開催, 5/2022
- 東 一織, 水野 忠快, 楠原 洋之, “A recommendation algorithm for predicting drug effects considering directionality”, CBI学会2022年大会, O1-6, タワーホール船堀, 10/2022
- 東 一織, 水野 忠快, 楠原 洋之, “GLDADec: Guided LDA deconvolution enabled us to identify cell type proportions”, CBI学会2023年大会, O1-2, タワーホール船堀, 10/2023
Domestic (Poster)
- 東 一織, 水野 忠快, 楠原 洋之, “Development of novel module detection method in gene co-expression network and its application to clinical data”, 第15回次世代を担う若手のための医療薬科学シンポジウム, P-20, オンライン開催, 10/2021
- 東 一織, 水野 忠快, 楠原 洋之, “Comparison of gene co-expression inference methods based on biological validity and diversity”, CBI学会, P07-02, オンライン開催, 10/2021
- 東 一織, 水野 忠快, 楠原 洋之, “Development of a novel algorithm for predicting drug effects considering directionality”, 第16回次世代を担う若手のための医療薬科学シンポジウム, P-22, 和歌山県立医科大学, 10/2022
- 東 一織, 水野 忠快, 森田 勝久, 楠原 洋之, “大規模毒性データベース利活用に向けたdeconvolution法の検討”, 第50回日本毒性学会学術年会, P1-097S, パシフィコ横浜, 6/2023
- 東 一織, 水野 忠快, 楠原 洋之, “Development of a method for estimating cell proportions using semi supervised topic modeling”, 2023年日本バイオインフォマティクス学会年会・第12回生命医薬情報学連合大会, P-44, 柏の葉カンファレンスセンター, 7/2023
Internships / Employment
Other Activities
- 2022 WINGS-LST/SPRING-GX general meeting (“Development of a novel module detection method in a gene coexpression network and its application to clinical data”), 6/2022
- 日本薬物動態学会第37回年会 学生・若手企業研究者シンポジウム オーガナイザー, 11/2022
- 2023 WINGS-LST/SPRING-GX general meeting (“Investigation of deconvolution methods for understanding tissue immune responses”), 6/2023
- 第10回 CBI若手の会講演会 (“GLDADec: Guided LDA deconvolution enabled us to identify cell type proportions”), 1/2024
- 第11回 CBI若手の会講演会 座長, 3/2024
- 2024 WINGS-LST/SPRING-GX general meeting (“GLDADec: marker-gene guided LDA modeling for bulk gene expression deconvolution”), 7/2024
Awards / Honors
- 2022, 第37回日本薬剤学会, 永井財団大学院生スカラシップ
- 2022, WINGS-LST/SPRING-GX general meeting, Outstanding Poster Award
- 2023, 第50回日本毒性学会学術年会, 学生ポスター発表賞
- 2023, WINGS-LST/SPRING-GX general meeting, Logical Design Award
- 2023, CBI学会2023年大会, 優秀口頭発表賞
Scholarships / Grants
- 2024/4-2026/3 研究助成 日本学術振興会特別研究員 DC2
- 2022年度 WINGS-LST 支援対象学生
- 2021/4-2023/3 JASSO 第一種貸与奨学金 業績優秀者免除(全額免除)